一、企業(yè)所得稅（集體企業(yè)）
1.超標準稅前列支各項費用。如，超比例計提補充養(yǎng)老保險、住房公積金，超標準計提效益工資，以及按個別地方政府文件規(guī)定繳納但稅法規(guī)定不得扣除的公益贊助、業(yè)務招待費、捐贈支出等。
2.未按權責發(fā)生制當期核算、當期攤銷。如有些往來款項的余額未調(diào)增當年應納稅所得額。
3.多計支出。在生產(chǎn)費用中多列支與生產(chǎn)無關的費用，如差旅費、會議費、業(yè)務招待費等。少數(shù)企業(yè)還存在多提折舊等多列成本費用的問題。
4.少計收入。未將房屋、設備出租收入、銷售處理廢舊物資、材料等非主營業(yè)務收入或其它收入計入企業(yè)應納稅所得額。
二、個人所得稅
1.發(fā)放各種補貼、考核獎金、防暑降溫費、報銷費用、補充養(yǎng)老保險及補充醫(yī)療保險等未并入當月工資薪金代扣代繳個人所得稅。
2.應在每月合并計算的個人收入，分類分項扣繳個人所得稅，從而重復扣除免征額，錯誤適用較低稅率，少繳稅款。
3.各企業(yè)使用的個人所得稅扣繳軟件不統(tǒng)一，扣繳方法不規(guī)范，稅額不準確。
三、其它稅種
1.因少計銷售收入、營業(yè)收入等問題，企業(yè)相應存在少征營業(yè)稅、城建稅、教育費附加等問題
2.簽定合同未繳印花稅。
